В мае 2020 года, когда во всём мире ещё действовали ограничения из-за COVID-19, богатый предприниматель Майлз Брон решает устроить необычную встречу на своём частном острове в Греции. Майлз — один из создателей огромной компании «Альфа», заработавший состояние на новых технологиях. Он рассылает своим старым друзьям сложные коробки-головоломки. Тот, кто сможет разгадать загадки внутри, получает приглашение на остров. Майлз обещает весёлую игру: гости должны будут раскрыть вымышленное убийство хозяина дома.
На приглашение откликаются все члены его старой компании друзей. Среди них учёный Лайонел, который руководит исследованиями в «Альфе»; Клэр — известный политик; Бёрди — бывшая модель и владелица модного бренда; Дюк — шумный интернет-ведущий; а также Энди Бранд, женщина, которая когда-то вместе с Майлзом основала компанию, но потом поссорилась с ним и ушла. Остальные давно прекратили с ней общение.
Когда гости прибывают на остров, их ждёт ещё один сюрприз. Вместе с ними появляется знаменитый сыщик Бенуа Блан. Все удивлены, потому что никто не знает, зачем он здесь. Сам Майлз тоже недоумевает. Наедине он говорит Блану, что не приглашал его и, вероятно, кто-то решил подшутить. Но раз уж сыщик приехал, хозяин разрешает ему остаться.
Остров выглядит роскошно. В центре стоит огромный стеклянный особняк необычной формы, который называют «Стеклянная луковица». Майлз с гордостью показывает гостям свою коллекцию произведений искусства. Он любит демонстрировать богатство и постоянно старается впечатлить окружающих. Самым удивительным экспонатом оказывается знаменитая картина «Мона Лиза», которую ему временно доверили хранить. Майлз даже показывает специальную систему безопасности, способную защитить картину в случае опасности.
Кроме того, он рассказывает о новом проекте компании. Речь идёт о топливе под названием «Клир». Майлз уверен, что это топливо изменит мир. Однако Лайонел и Клэр выглядят обеспокоенными. Они знают, что технология ещё не проверена и может быть опасной, но всё равно поддерживают Майлза, потому что слишком многое поставлено на карту.
Вечером начинается обещанная игра. По сценарию кто-то должен «убить» Майлза, а остальные обязаны вычислить преступника. Но Бенуа Блан почти сразу разрушает весь замысел. Он быстро замечает все подсказки и буквально за несколько минут раскрывает вымышленное преступление. Майлз разочарован: игра закончилась, едва начавшись.
После этого атмосфера становится напряжённой. Между гостями вспыхивают старые обиды и споры. Особенно остро конфликтует Энди с остальными. Она обвиняет бывших друзей в предательстве и в конце концов сердито уходит.
Вскоре происходит настоящее несчастье. Во время разговора Дюк внезапно делает глоток из стакана, который стоял перед Майлзом, и почти сразу падает замертво. Начинается паника. Все понимают, что это уже не игра. Кто-то действительно убил человека.
Подозрения сразу падают на Энди. Ведь незадолго до этого она поссорилась со всеми присутствующими и выглядела очень злой. Из-за плохой погоды полиция не может быстро добраться до острова, поэтому гости оказываются заперты вместе с возможным убийцей.
Ситуация становится ещё тревожнее, когда выясняется, что исчез пистолет Дюка. Затем во всём особняке неожиданно гаснет свет. Люди в страхе разбегаются по разным комнатам. В этой неразберихе Бенуа Блан находит Энди. Однако неожиданно неизвестный стреляет в неё. Кажется, что она погибает.
После этого сыщик собирает всех вместе и говорит загадочную фразу. Он объясняет, что сумел снять верхние слои тайны, но добраться до самого центра может только один человек — тот, кто знает правду о смерти Кассандры Бранд.
И тут фильм делает резкий поворот.
Зрителям показывают события, происходившие до поездки на остров. Выясняется, что настоящая Энди, полное имя которой Кассандра Бранд, на самом деле умерла за неделю до этих событий. Её нашли дома, и всё выглядело как самоубийство.
Но у Энди была сестра-близнец по имени Хелен. Именно её Блан встретил раньше. Хелен не поверила в самоубийство сестры и обратилась к знаменитому сыщику за помощью. Она была уверена, что Энди убили.
Постепенно становится понятна история конфликта. Когда-то именно Энди вместе с Майлзом придумала идею компании «Альфа». Но позже Майлз отстранил её от дел и фактически выгнал. Энди подала в суд, пытаясь доказать свои права на компанию. Главным доказательством была старая салфетка, на которой много лет назад был записан первоначальный план создания бизнеса.
Однако в суде бывшие друзья поддержали Майлза. Они заявили, что идея принадлежала именно ему. Из-за этих показаний Энди проиграла дело.
Незадолго до смерти Энди отправила всем письмо. В нём была фотография той самой оригинальной салфетки. Получалось, что она наконец нашла доказательство своей правоты. Если бы документ попал в суд, репутация Майлза рухнула бы, а вместе с ней могли пострадать и все остальные.
Хелен заподозрила, что кто-то убил её сестру, чтобы не дать правде выйти наружу. Тогда Бенуа придумал план. Поскольку о смерти Энди ещё никто не знал, Хелен должна была притвориться сестрой и отправиться на остров. Так они надеялись вычислить убийцу.
Во время пребывания на острове Хелен и Блан внимательно наблюдают за каждым гостем. Они выясняют, что у всех есть причины защищать Майлза. Лайонел связал свою карьеру с опасным топливом «Клир». Клэр построила политические планы, рассчитывая на успех этого проекта. Бёрди зависит от денег Майлза, потому что вокруг её бизнеса разгорелся скандал. Дюк надеется получить выгодную работу благодаря связям с компанией.
Также становится известно, что в день смерти Энди каждый из них приезжал к её дому. Это делает всех подозреваемыми.
Когда в Хелен стреляют на острове, выясняется ещё одна деталь. Пуля не убила её только потому, что в кармане лежал толстый дневник сестры. Он остановил выстрел. Поэтому все считают её мёртвой, а она получает возможность тайно продолжить поиски.
Пока остальные уверены, что Энди погибла, Хелен пробирается в кабинет Майлза и ищет пропавшую салфетку.
Наконец Бенуа Блан собирает всех и раскрывает тайну. Он объявляет, что убийца — сам Майлз Брон.
Сначала окружающие не могут поверить. Майлз кажется слишком самоуверенным и даже немного нелепым человеком. Но именно это и мешало сыщику раньше увидеть очевидное.
Блан объясняет всю цепочку событий. Когда Майлз узнал, что Энди нашла старую салфетку, он понял, что его положение под угрозой. Тогда он приехал к ней домой, подмешал ей сильное вещество и инсценировал самоубийство.
Однако была проблема. Дюк случайно видел Майлза возле дома Энди в тот самый день. Позже, уже на острове, Дюк увидел в телефоне сообщение о смерти Энди и сразу всё понял. Он догадался, что Майлз имеет отношение к её гибели.
После этого Дюк решил использовать свои знания для шантажа. Он рассчитывал получить выгоду. Но Майлз не захотел рисковать. Зная, что у Дюка смертельная аллергия на ананас, он подмешал ему ананасовый сок в напиток. Именно поэтому Дюк умер прямо за столом.
Затем Майлз забрал его пистолет. Позже, во время отключения света, он выстрелил в Хелен, опасаясь, что она найдёт доказательства.
В этот момент Хелен действительно обнаруживает в кабинете ту самую салфетку. Она показывает находку всем присутствующим и раскрывает свою настоящую личность. Кажется, что победа уже близка.
Но Майлз идёт на крайние меры. Он выхватывает салфетку и сжигает её. Единственное прямое доказательство исчезает. Более того, бывшие друзья снова отказываются выступить против него. Они боятся потерять положение, деньги и влияние.
Блан понимает, что юридически сделать больше ничего не может. Он говорит Хелен, что теперь всё зависит от неё, и выходит из дома.
Хелен приходит в ярость. Она начинает разбивать дорогие стеклянные скульптуры Майлза. Сначала остальные пытаются её остановить, но постепенно сами присоединяются к разрушению. Их отношение к Майлзу начинает меняться.
В конце концов Хелен берёт образец топлива «Клир» и бросает его в огонь. Происходит мощный взрыв. Особняк охватывает пожар. Огромное стеклянное здание разрушается прямо на глазах хозяина.
Самое страшное для Майлза — огонь уничтожает и «Мону Лизу». Теперь весь мир узнает, что его опасное топливо стало причиной катастрофы. Скрыть правду уже невозможно.
После этого его бывшие друзья понимают, что защищать Майлза больше бессмысленно. Его влияние исчезло. Репутация разрушена. Теперь они готовы рассказать полиции всё, что знают.
Фильм заканчивается сценой на берегу моря. Хелен и Бенуа Блан смотрят на горящий особняк. Вдалеке появляются полицейские катера. Майлза ждёт расследование, а правда о смерти Энди наконец выходит наружу. Главная идея истории заключается в том, что иногда самые сложные загадки оказываются удивительно простыми, а за красивой оболочкой может скрываться пустота. Именно поэтому «Стеклянная луковица» в итоге оказывается не хитроумной головоломкой, а историей о человеческой жадности, трусости и предательстве.
